元嘉二年（公元425年），刘义隆已经当了5个月皇帝了，徐羡之、傅亮上表归政，他心中暗暗高兴，但表面上却又表现出厌烦，假意不答应，只到徐、傅三次上表，他才表示勉强接受，开始亲自理政。在他自己处理政事的过程中，他暗中加紧准备。
第二年，他觉得时机已经成熟，于是下诏揭徐、傅、谢等人的罪恶，命令有关部门捉拿。当时谢晦的弟弟正在中书省值勤，得知信息后慌忙派人通告徐、傅二人。当时这两人正在上朝的路上，听闻消息后急忙往回逃跑。徐羡之跑到城外烧陶的洞里自己上吊而死；傅亮在跑的途中被抓回，刘义隆念当年是他迎自己当皇帝的，于是只杀了他，放过了他的妻儿。
接着，刘义隆又下令戒严，派大将到彦之等讨伐谢晦，后来又派王弘、檀道济等人一齐攻打。有人认为任用曾参加废立的檀道济统军不合适，但文帝认为檀道济当时参与废立只是协从，认为经此安抚必然会效死力。谢晦开始没有把朝廷大军放在眼里，也取得小小的胜利。但后来，当他听说身经百战的将军檀道济率军一起来攻打他的时候，便慌了阵脚，一战就败，在逃亡中被抓，送往建康后被斩。